Ketika “Siren”, kekuatan alien dengan persenjataan yang jauh melampaui batas teknologi saat ini, tiba-tiba muncul, umat manusia yang terbagi berdiri dalam solidaritas penuh untuk pertama kalinya. Empat negara—Eagle Union, Royal Navy, Sakura Empire, dan Iron Blood—membentuk Azur Lane, membuka jalan bagi peningkatan peperangan modern, yang menghasilkan kemenangan awal melawan ancaman bersama. Namun, persatuan yang lemah ini terancam oleh cita-cita yang berlawanan, membagi aliansi menjadi dua. Kekaisaran Sakura dan Darah Besi memisahkan diri dan membentuk Sumbu Merah, dan umat manusia menjadi terfragmentasi sekali lagi.
Sebagai petarung berpengalaman dan berpengalaman, Perusahaan “Grey Ghost” memikul harapan Azur Lane untuk mengakhiri perang. Tapi di balik kepribadian tabahnya menyembunyikan seorang gadis lemah, takut laut. Meski begitu, dia terus berjuang karena dia percaya bahwa itu satu-satunya tujuan keberadaannya. Sementara itu, Javelin, Laffey, dan Unicorn — tiga kapal dari serikat pekerja — menemukan Ayanami, mata-mata dari Poros Merah. Meski kelihatannya aneh, mereka mencoba berteman dengannya, tetapi sebagai musuh, usaha mereka sia-sia. Tetap saja, mereka bertahan dengan harapan akan berhasil suatu hari nanti.
Di tengah konflik yang tak berkesudahan dalam umat manusia, kunci yang dapat menyatukan ras yang terfragmentasi mungkin ada: seorang prajurit yang berdamai dengan kepribadian misteriusnya dan persahabatan di antara mereka yang memiliki cita-cita berbeda.
