Koyomi Araragi, seorang siswa sekolah menengah tahun ketiga, berhasil selamat dari serangan vampir dengan bantuan Meme Oshino, seorang pria aneh yang tinggal di sebuah bangunan yang ditinggalkan. Meskipun diselamatkan dari vampir dan sekarang menjadi manusia lagi, beberapa efek samping seperti kemampuan penyembuhan manusia super dan peningkatan penglihatan masih ada. Terlepas dari itu, Araragi mencoba menjalani kehidupan sebagai siswa normal, dengan bantuan temannya dan ketua kelas, Tsubasa Hanekawa.
Ketika sesama teman sekelas Hitagi Senjougahara jatuh dari tangga dan ditangkap oleh Araragi, anak laki-laki itu menyadari bahwa gadis itu tidak memiliki bobot yang wajar. Terlepas dari protes Senjougahara, Araragi bersikeras dia membantunya, memutuskan untuk meminta bantuan Oshino, pria yang pernah membantunya dengan kesulitannya sendiri.
Melalui beberapa kisah yang melibatkan setan dan dewa, Bakemonogatari mengikuti Araragi saat dia berusaha membantu mereka yang menderita penyakit supernatural.
