Dalam dunia paralel yang dikenal sebagai Gamindustri, empat Dewi berkuasa atas empat dunia berbeda: Planeptune, Lastation, Lowee, dan Leanbox. Setiap Dewi merupakan personifikasi dari konsol game utama dalam generasi ke-7, seperti Neptune untuk Sega Neptune, Noire untuk PlayStation 3, Blanc untuk Wii, dan Vert untuk Xbox 360.
Seri anime ini mengikuti petualangan Neptune, Dewi dari Planeptune, bersama dengan saudara perempuannya yang mungil, Nepgear, serta teman-teman Dewi lainnya. Dalam perjuangan mereka melawan kejahatan, mereka juga berusaha menjaga keseimbangan dan persahabatan di antara keempat dunia mereka, sering kali harus melawan ancaman yang berusaha merusak kedamaian.
Namun, ancaman terbesar mungkin bukanlah dari musuh eksternal, melainkan dari konflik internal dan persaingan antara Dewi-dewi ini. Ketika godaan kekuasaan dan egoisme mempengaruhi hubungan mereka, mereka harus belajar untuk bekerja sama dan mengatasi perbedaan mereka agar dapat melindungi dunia yang mereka cintai.
Choujigen Game Neptune The Animation menggabungkan elemen komedi, aksi, dan drama, dengan banyak referensi ke industri permainan video dan budaya pop. Seri ini juga menawarkan pesan mendalam tentang arti persahabatan dan kerja sama, serta pentingnya menghargai perbedaan orang lain.
