Qualidea Code adalah anime aksi dan fiksi ilmiah yang berlatar di dunia pasca-apokaliptik. Kisah ini berpusat pada sekelompok remaja yang diberi kekuatan khusus untuk melawan ancaman misterius yang dikenal sebagai “Unknown.”
Setelah serangan mendadak oleh Unknown yang menghancurkan banyak kota di seluruh dunia, populasi manusia terancam punah. Untuk melawan ancaman ini, beberapa kota yang selamat membentuk aliansi dan melatih para remaja yang memiliki kekuatan khusus yang disebut “World.” Mereka dipilih berdasarkan kekuatan yang mereka miliki dan dibagi menjadi tiga kelompok: Kanagawa, Chiba, dan Tokyo.
Cerita berfokus pada tiga protagonis utama: Ichiya Suzaku, seorang pemimpin yang tangguh dan bersemangat dari Tokyo; Canaria Utara, seorang gadis misterius dengan kemampuan penyembuhan yang luar biasa dari Kanagawa; dan Asuha Chigusa, seorang gadis tomboi yang kuat dari Chiba. Mereka adalah bagian dari kelompok remaja yang dipilih untuk melindungi kota mereka masing-masing dan membasmi Unknown.
Namun, ketika sekelompok anak muda yang bertempur bersama, mereka mulai menemukan rahasia gelap yang melibatkan asal-usul kekuatan mereka dan tujuan sebenarnya dari serangan Unknown. Mereka harus menghadapi konflik internal dan eksternal yang rumit sambil mencari kebenaran di balik musuh misterius yang mereka hadapi.
